# Covalent Binding 설정
## Covalent Binding
Covalent Binding은 **개별 분자별로 Warhead와 Product form을 직접 설정**하여\
단백질과의 **Covalent 결합 가능성**을 예측하는 기능입니다.
* 특정 분자에 대해
* 특정 Warhead 반응과
* 명확한 결합 형태(Product form)를 가정하고
정밀한 Covalent 결합 예측을 수행할 때 사용합니다.
***
### 1. Covalent 단백질 활성화
* **Bench**로 이동합니다.
* 실험에 사용할 **Covalent 타입 단백질**을 활성화합니다.
> Covalent Binding은\
> 반드시 Covalent 단백질이 활성화된 상태에서만 실행할 수 있습니다.
***
### 2. 분자 선택 및 Hyper Binding 실행
* Covalent Binding을 수행할 분자의 **Hyper Binding 실행** 버튼을 클릭합니다.
***
### 3. Warhead 설정
* 설정 창에서 **Warhead로 사용할 분자 구조 영역**을 선택합니다.
* 선택한 Warhead를 기준으로 Product form이 생성됩니다.
***
### 4. Product form 선택
* 선택한 Warhead를 기반으로 제공되는 **Product form 목록**을 확인합니다.
* 사용할 **Product form**을 선택합니다.
***
### 5. Product form 직접 추가 (선택)
원하는 Product form이 제공되지 않는 경우,\
**직접 Product form을 정의**할 수 있습니다.
#### Product form 직접 추가 방법
* **Product form 추가** 버튼을 클릭합니다.
* 설정 화면에서 다음 정보를 확인합니다.
* Target **Residue**
* 분자 구조
* **Residue와 분자구조를 연결**하여 Product form을 직접 그립니다.
* Product form 설정이 완료되면 **추가** 버튼을 클릭합니다.
***
### 6. Product form 최종 선택
* 제공된 Product form 또는\
직접 추가한 Product form 중 **하나를 선택**합니다.
선택한 Product form을 기준으로 Covalent Binding 계산이 수행됩니다.
***
### 7. Binding 계산 결과 확인
* Binding 계산이 완료되면 **Binding score**를 확인할 수 있습니다.
* 설정한 Warhead와 Product form을 기반으로\
Covalent 결합 가능성이 수치로 제공됩니다.
***
### 8. Warhead 정보 확인
* 적용된 Warhead는 **Bench 필드**에서 확인할 수 있습니다.
* `필드 추가 > Covalent > Warhead` 필드를 활성화합니다.
* 각 분자에 적용된 **Warhead 정보**가 테이블에 표시됩니다.
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# Agent Instructions: Querying This Documentation
If you need additional information that is not directly available in this page, you can query the documentation dynamically by asking a question.
Perform an HTTP GET request on the current page URL with the `ask` query parameter:
```
GET https://docs.hits.ai/docs-ko/project-feature-ko/bench/covalent-binding.md?ask=
```
The question should be specific, self-contained, and written in natural language.
The response will contain a direct answer to the question and relevant excerpts and sources from the documentation.
Use this mechanism when the answer is not explicitly present in the current page, you need clarification or additional context, or you want to retrieve related documentation sections.