Covalent Binding은 개별 분자별로 Warhead와 Product form을 직접 설정하여 단백질과의 Covalent 결합 가능성을 예측하는 기능입니다.
특정 분자에 대해
특정 Warhead 반응과
명확한 결합 형태(Product form)를 가정하고
정밀한 Covalent 결합 예측을 수행할 때 사용합니다.
Bench로 이동합니다.
실험에 사용할 Covalent 타입 단백질을 활성화합니다.
Covalent Binding은 반드시 Covalent 단백질이 활성화된 상태에서만 실행할 수 있습니다.
Covalent Binding을 수행할 분자의 Hyper Binding 실행 버튼을 클릭합니다.
설정 창에서 Warhead로 사용할 분자 구조 영역을 선택합니다.
선택한 Warhead를 기준으로 Product form이 생성됩니다.
선택한 Warhead를 기반으로 제공되는 Product form 목록을 확인합니다.
사용할 Product form을 선택합니다.
원하는 Product form이 제공되지 않는 경우, 직접 Product form을 정의할 수 있습니다.
Product form 추가 버튼을 클릭합니다.
설정 화면에서 다음 정보를 확인합니다.
Target Residue
분자 구조
Residue와 분자구조를 연결하여 Product form을 직접 그립니다.
Product form 설정이 완료되면 추가 버튼을 클릭합니다.
제공된 Product form 또는 직접 추가한 Product form 중 하나를 선택합니다.
선택한 Product form을 기준으로 Covalent Binding 계산이 수행됩니다.
Binding 계산이 완료되면 Binding score를 확인할 수 있습니다.
설정한 Warhead와 Product form을 기반으로 Covalent 결합 가능성이 수치로 제공됩니다.
적용된 Warhead는 Bench 필드에서 확인할 수 있습니다.
필드 추가 > Covalent > Warhead 필드를 활성화합니다.
필드 추가 > Covalent > Warhead
각 분자에 적용된 Warhead 정보가 테이블에 표시됩니다.
마지막 업데이트 5개월 전
