# 단백질 구조 불러오기

* 단백질 구조는 세 가지 방법으로 불러올 수 있습니다.

### 방법 1.  PDB ID를 입력하여 불러오기

* 단백질의 3차원 구조가 규명되어 있는 경우 (X-ray, Cryo-EM, NMR 등) PDB ID를 입력하여 정보를 불러올 수 있습니다.

1. **\[ Structure 신규 등록 ]** 아래 **\[ 타입 ]**에서 **\[** **PDB ]**를 선택합니다. 

<figure><img src="/files/4mj4hXZxhxLn0jfUEjeK" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

2. **\[ ID ]** 란에 PDB ID를 입력합니다. PDB ID는 [RCSB](https://www.rcsb.org/)에서 찾을 수 있습니다.

<figure><img src="/files/MovPQUBTt0vv7AbSArCQ" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

3. **\[ 찾아보기 ]** 버튼을 클릭하면 단백질 3차원 구조와 단백질을 구성하는 chain 및 small molecule들의 정보를 확인할 수 있습니다.

<figure><img src="/files/Bu4Ed6RqOH9hQK4WciL9" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

<figure><img src="/files/z4v66Z44aOMYJqa71T0B" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

### 방법 2. Alphafold 구조 불러오기

* 단백질 3차원 구조가 실험적으로 규명되어 있지 않은 경우 예측 구조를 활용할 수 있습니다.

1. **\[ Structure 신규 등록 ]** 아래 **\[ 타입 ]**&#xC5D0;서 **\[ Alphafold ]**&#xB97C; 선택합니다.

<figure><img src="/files/2GbAJxYYIB8ofQ2HJved" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

2. **\[ ID ]** 란에 단백질 UniProt ID를 입력합니다. UniProt ID는 [UniProt](https://www.uniprot.org/)에서 찾을 수 있습니다.

<figure><img src="/files/RmXtaPlv7PLkkaWtAMuL" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

3. **\[ 찾아보기 ]**&#xB97C; 클릭하면 UniProt ID에 해당하는 Alphafold 구조를 불러옵니다.

<figure><img src="/files/BBxna88YepNjyOGQdyIE" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

<figure><img src="/files/K9Gk800OhXNJbldN3kRU" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

{% hint style="warning" %}
Alphafold 구조는 약물이 결합한 단백질 구조가 아니기 때문에 약물의 결합 위치 및 구조 정보를 제공하지 않습니다. 따라서 Alphafold 구조를 사용할 경우 사용자가 직접 결합 위치를 정의해야 합니다. ([결합 부위 정의하기 (1)](/docs-ko/project-feature-ko/protein_structure/binding_site_1.md)).&#x20;

또한 약물 결합에 의한 구조 변화가 큰 단백질의 경우 Alphafold는 약물의 결합 구조를 예측하는데 적합하지 않을 수 있습니다.
{% endhint %}

### 방법 3. PDB 파일 직접 업로드하여 불러오기

* 비공개 단백질 구조나 사용자가 특수한 목적에 따라 변형한 단백질 구조 등의 사용을 원할 경우 구조 파일을 업로드하여 사용할 수 있습니다.

1. **\[ Structure 신규 등록 ]** 아래 **\[ 타입 ]**&#xC5D0;서 **\[ Custom ]**&#xC744; 선택합니다.

<figure><img src="/files/gR4u0lUuo1flzdEpp1St" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

2. **\[ 찾아보기 ]** 버튼을 클릭하면 파일 검색창이 열립니다.

<figure><img src="/files/5r0BuCw0Ws2rbxv8tUoR" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

3. 사용하고자 하는 PDB 파일을 선택한 후, **\[ 열기 ]** 버튼을 누르면 구조를 불러올 수 있습니다.

<figure><img src="/files/2ouq06sK5MFXie0jgW28" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

<figure><img src="/files/GyaKPjL6Q9UeTsT4u2kL" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

{% hint style="info" %}
*in silico* point mutation 등 변형한 단백질 구조가 필요한 경우, 해당 방법으로 단백질 구조를   불러올 수 있습니다.
{% endhint %}


---

# Agent Instructions: Querying This Documentation

If you need additional information that is not directly available in this page, you can query the documentation dynamically by asking a question.

Perform an HTTP GET request on the current page URL with the `ask` query parameter:

```
GET https://docs.hits.ai/docs-ko/project-feature-ko/protein_structure/load.md?ask=<question>
```

The question should be specific, self-contained, and written in natural language.
The response will contain a direct answer to the question and relevant excerpts and sources from the documentation.

Use this mechanism when the answer is not explicitly present in the current page, you need clarification or additional context, or you want to retrieve related documentation sections.