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# 분자 등록하기

 표적 단백질의 구조를 등록 하였다면 이제 실험하고자 하는 분자들의 구조를 등록합니다.

* **\[ My Bench ]** -> **\[ 분자 목록 ]** ->**\[ + 분자 추가 ]** 

<figure><img src="/files/iUlwbvLfQjdkgiKyKByn" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

* **\[ + 분자 추가 ]** 아이콘을 클릭하면 아래와 같이 분자 구조를 그리기 위한 2D 편집기 창이 열립니다.&#x20;

<figure><img src="/files/ffbW92qMzaVj3vBCQ4o9" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

분자 구조는 다음의 2가지 방법으로 등록할 수 있습니다:

1. 분자 구조를 직접 등록하기
2. 분자 구조 정보 파일을 업로드하여 등록하기

### 방법 1. 분자 구조를 직접 등록하기

#### 방법 1.1 편집기를 이용해 분자 그리기

2D 편집기를 사용하여 분자 구조를 직접 그리거나 SMILES 코드를 입력 할 수 있습니다.

<figure><img src="/files/2FpnQi5lbeAKRUv4nWTr" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

1. 캔버스
2. 분자 이름 입력 칸
3. SMILES ([Simplified molecular-input line-entry system](https://en.wikipedia.org/wiki/Simplified_molecular-input_line-entry_system)) 코드 입력 칸
4. 세션 관련 탭\
   (왼쪽부터) 캔버스 초기화/파일 열기/분자 저장/분자 복사/분자 붙여넣기/분자 자르기
5. 이전 작업 취소, 기존 작업 다시 수행
6. 분자 물성 관련 탭\
   (왼쪽부터) 분자 방향성(aromatic) 성질 표시/방향성 성질 표시 해제/분자 위치 재조정/분자 형태 정리/분자 CIP 정리/분자 상태 체크하기/분자 물성 계산하기
7. 설정 관련 탭\
   (왼쪽부터) 편집기 설정/도움/편집기 툴 정보/편집기 창 최대화
8. 캔버스 확대/축소 비율 설정 아이콘
9. 분자 편집 탭\
   (위에서부터) 분자 이동/Lasso 방식 선택/지우개/결합(Bond) 형태 설정/Chain 입력/분자 입체배치(stereochemistry) 적용/양전하 부여/음전하 부여/자극(S) 그룹 설정/반응(R) 그룹 라벨 설정
10. 원소 선택 탭 (\*PT: 원소 주기율표)
11. Ring 구조 선택 탭 (\*맨 오른쪽 아이콘은 substructure 라이브러리)

#### 방법 1.2 SMILES 코드 입력하여 분자 그리기

* SMILES 코드를 입력하여 분자 구조를 등록하는 경우, 위 그림 2번의 **\[ SMILES 입력 ]** 아이콘을 클릭한 후, 아래 그림 1번 칸에 SMILES 코드를 입력하여 2번의  **\[ 추가 ]** 버튼을 클릭하면 분자 구조가 캔버스에서 입력되는 것을 확인 할 수 있습니다.
* 다른 곳에서 SMILES 코드를 복사하고(Ctrl+C) 2D 편집기의 캔버스를 마우스 왼쪽 클릭 한 후 붙여넣기(Ctrl+V)하여 분자 구조를 입력 할 수 있습니다.

<figure><img src="/files/vnFDXI6l0tezYvmqiCVH" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

<figure><img src="/files/Sa9WzOC5DGKdEhXBXhHY" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

### 방법 2. 분자 구조 정보 파일을 업로드하여 등록하기

분자 정보 파일을 업로드하여 등록하는 경우 분자 등록 창 위쪽 탭 중 **\[ 분자 업로드 ]** 탭으로 변경합니다.

<figure><img src="/files/CtOHg9u1itzPiK1vYqCF" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

1. 분자 파일 업로드 아이콘
2. 파일 확장자 별 예시 파일 다운로드 아이콘

분자 파일 업로드는: 1) **\[ 파일 업로드 ]** 아이콘에 파일을마우스 드래그&드롭을 하거나, 2) **\[ 파일 업로드 ]** 아이콘을 클릭하여 원하는 파일을 선택하여 진행할 수 있습니다.

하이퍼랩에서 지원하는 분자 정보 파일 형식은 SDF, TSV, CSV, CDXML 네 가지며, 각 확장자 별 형식은 아래와 같습니다:

1. SDF: Structural Data File의 약자로 아래와 같은 형식으로 구성되어 있습니다.

<figure><img src="/files/5YOOEt5N3y9vHOvc5wZQ" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

2. TSV: 목록 방식으로 작성되어 있으며 {분자이름}{탭}{SMILES} 형식으로 이루어져 있습니다

<figure><img src="/files/MBdQNuldmY0aYvisi7VN" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

3. CSV: TSV 확장자 형식과 같이 목록 방식으로 작성되어 있으며 {분자이름},{SMILES} 형식으로 이루어져 있습니다

<figure><img src="/files/1t3MOuc392iEGgFnGAyZ" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

4. CDXML: ChemDraw XML 파일 확장자로 아래와 같은 포맷을 가지고 있습니다

<figure><img src="/files/R888IuvAMO0gmjZUzgwZ" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

분자 파일을 업로드하면 아래 그림의 1과 같이 파일이 목록으로 나타나며 2의 **\[ 추가 ]** 버튼을 클릭하여 등록을 완료합니다.

<figure><img src="/files/0Ko5KvGQA0kmGjZPSPNx" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

{% hint style="info" %}
**\[ 추가 ]** 버튼의 오른쪽에 화살표 표시의 아이콘을 클릭하면 파일 업로드와 함께 하이퍼 바인딩이나 Hyper ADME/T 계산을 실행하도록 설정할 수 있습니다.
{% endhint %}

<figure><img src="/files/KJionfTNbilBJUKjcliL" alt=""><figcaption></figcaption></figure>

<figure><img src="/files/XuVYHbnBpe2v8H4Kox8o" alt=""><figcaption></figcaption></figure>