업로드 권장 파일 형식

분석을 위해 아래 형식의 업로드 파일을 권장하며, 명시되지 않은 파일도 업로드 가능합니다.

1. 시퀀싱 Raw/Processed 데이터

포맷	확장자	용도
FASTQ	.fastq, .fq, .fastq.gz	NGS raw reads
FASTA	.fasta, .fa, .fna, .faa	시퀀스 참조/결과
BAM	.bam	Aligned reads (binary)
SAM	.sam	Aligned reads (text)
CRAM	.cram	압축된 alignment
SRA	.sra	NCBI SRA 아카이브

2. 변이/유전체 분석

포맷	확장자	용도
VCF	.vcf, .vcf.gz	Variant calling 결과
BCF	.bcf	Binary VCF
BED	.bed	Genomic intervals
GFF/GTF	.gff, .gff3, .gtf	유전자 annotation
BigWig	.bw, .bigwig	Coverage/signal tracks
Wiggle	.wig	Coverage data

3. 전사체/발현 데이터

포맷	확장자	용도
Count Matrix	.tsv, .csv, .txt	발현량 매트릭스
H5AD	.h5ad	Single-cell (AnnData)
MTX	.mtx	Sparse matrix (10x Genomics)
Loom	.loom	Single-cell 데이터
RDS	.rds	R Seurat 객체
CEL	.cel	Affymetrix microarray

4. 단백질체/대사체

포맷	확장자	용도
mzML	.mzml	Mass spec 표준
mzXML	.mzxml	Mass spec (legacy)
MGF	.mgf	Peak lists
PDB	.pdb	단백질 구조
mmCIF	.cif	단백질 구조 (신규 표준)

5. 범용/메타데이터

포맷	확장자	용도
테이블	.csv, .tsv, .xlsx	샘플 메타데이터, 결과
JSON	.json	설정, 파이프라인 정의
YAML	.yaml, .yml	설정 파일
PDF	.pdf	리포트

6. 인덱스/보조 파일

포맷	확장자	용도
BAM Index	.bai	BAM 인덱스
FASTA Index	.fai	FASTA 인덱스
Tabix Index	.tbi	VCF/BED 인덱스